動植物基因組定序

動植物基因組定序

De Novo基因組定序 (De Novo Sequencing)

De Novo測序是對全基因組進行片段測序,並對測序數據進行拼接、組裝,從而獲得該物種的基因組序列圖譜,而不需要任何其他參考序列資料。當全基因組序列圖譜完成後,可構建該物種的基因組數據庫,為後續的基因挖掘、功能驗證提供DNA序列信息,開啟新物種的研究。

樣本需求

1. DNA 總量 ≧ 5 ug
2. DNA 濃度 ≧ 30 ng/ul
3. 260/230 ≥ 1.5
4. 260/280 ≥ 1.8

定序規格

1. 深度>100X
2. >12 G rawdata base, Pair-end 150 sequencing

❖ 動植物基因體重定序 (Resequencing for Animals & Plants)

對基因序列已知的物種進行基因組的重定序,從而研究個體或群體基因組水平的差異性,可全面挖掘基因組序列差異和結構變異,並可篩選與生物體重要性狀相關的基因位點。相對De Novo測序,耗時更短、成本更低。

樣本需求

1. DNA 總量 ≧ 5 ug
2. DNA 濃度 ≧ 30 ng/ul
3. 260/230 ≥ 1.5
4. 260/280 ≥ 1.8

定序規格

1. 深度>30X
2. >12 G rawdata base, Pair-end 150 sequencing